MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 1335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	TCT	2	6	1063	1068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802305
2	NC_017457	CGA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802305
3	NC_017457	TAG	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802305
4	NC_017457	AGG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802305
5	NC_017457	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802306
6	NC_017457	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802306
7	NC_017457	G	6	6	1301	1306	0 %	0 %	100 %	0 %	385802306
8	NC_017457	GAT	3	9	1311	1319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802306
9	NC_017457	GCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802306
10	NC_017457	GGATG	2	10	1446	1455	20 %	20 %	60 %	0 %	385802306
11	NC_017457	CGA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802307
12	NC_017457	TC	4	8	1802	1809	0 %	50 %	0 %	50 %	385802307
13	NC_017457	TCA	2	6	1819	1824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
14	NC_017457	T	6	6	1858	1863	0 %	100 %	0 %	0 %	385802307
15	NC_017457	TCA	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
16	NC_017457	AAG	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802307
17	NC_017457	GTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802307
18	NC_017457	ATC	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
19	NC_017457	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802307
20	NC_017457	ACT	2	6	2129	2134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
21	NC_017457	GGTGA	2	10	2469	2478	20 %	20 %	60 %	0 %	385802308
22	NC_017457	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802308
23	NC_017457	AT	3	6	2495	2500	50 %	50 %	0 %	0 %	385802308
24	NC_017457	ATAC	2	8	2554	2561	50 %	25 %	0 %	25 %	385802308
25	NC_017457	GGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802308
26	NC_017457	TGG	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802308
27	NC_017457	GATG	2	8	2690	2697	25 %	25 %	50 %	0 %	385802308
28	NC_017457	CAT	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802308
29	NC_017457	ACTG	2	8	2931	2938	25 %	25 %	25 %	25 %	385802308
30	NC_017457	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802309
31	NC_017457	TAA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802309
32	NC_017457	GA	3	6	3356	3361	50 %	0 %	50 %	0 %	385802309
33	NC_017457	GTG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802309
34	NC_017457	A	6	6	3438	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	385802309
35	NC_017457	GTT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802309
36	NC_017457	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802309
37	NC_017457	GTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802310
38	NC_017457	AGA	2	6	3763	3768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802310
39	NC_017457	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802310
40	NC_017457	TCC	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802310
41	NC_017457	AGC	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802310
42	NC_017457	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802310
43	NC_017457	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802310
44	NC_017457	CCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802310
45	NC_017457	CGT	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802310
46	NC_017457	TAC	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802310
47	NC_017457	ATTG	2	8	4090	4097	25 %	50 %	25 %	0 %	385802310
48	NC_017457	TGA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802311
49	NC_017457	A	6	6	4466	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	385802311
50	NC_017457	GAC	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802311
51	NC_017457	A	6	6	4500	4505	100 %	0 %	0 %	0 %	385802311
52	NC_017457	TGG	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802311
53	NC_017457	CTG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802311
54	NC_017457	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802312
55	NC_017457	TGAG	2	8	4909	4916	25 %	25 %	50 %	0 %	385802312
56	NC_017457	AT	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	385802312
57	NC_017457	GATT	2	8	4962	4969	25 %	50 %	25 %	0 %	385802312
58	NC_017457	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802312
59	NC_017457	TA	3	6	5092	5097	50 %	50 %	0 %	0 %	385802312
60	NC_017457	GTT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802312
61	NC_017457	AGC	2	6	5254	5259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802312
62	NC_017457	AGA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802312
63	NC_017457	GAG	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802312
64	NC_017457	CTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802312
65	NC_017457	GAC	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
66	NC_017457	AGA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802313
67	NC_017457	TCC	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802313
68	NC_017457	TGA	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
69	NC_017457	GAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
70	NC_017457	CTCGC	2	10	6703	6712	0 %	20 %	20 %	60 %	385802313
71	NC_017457	TAT	2	6	6731	6736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802313
72	NC_017457	ATGG	2	8	6759	6766	25 %	25 %	50 %	0 %	385802313
73	NC_017457	T	6	6	6773	6778	0 %	100 %	0 %	0 %	385802313
74	NC_017457	GAG	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802313
75	NC_017457	ATC	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802313
76	NC_017457	CGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
77	NC_017457	CAA	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802313
78	NC_017457	TC	3	6	7013	7018	0 %	50 %	0 %	50 %	385802313
79	NC_017457	TCG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
80	NC_017457	CGA	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
81	NC_017457	TGA	2	6	7163	7168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
82	NC_017457	GGT	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802313
83	NC_017457	ATG	3	9	7279	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
84	NC_017457	TGG	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802313
85	NC_017457	CTAT	2	8	7303	7310	25 %	50 %	0 %	25 %	385802313
86	NC_017457	AC	3	6	7373	7378	50 %	0 %	0 %	50 %	385802313
87	NC_017457	GGTG	2	8	7398	7405	0 %	25 %	75 %	0 %	385802313
88	NC_017457	TGA	3	9	7475	7483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
89	NC_017457	TGA	2	6	7526	7531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
90	NC_017457	TTGAG	2	10	7591	7600	20 %	40 %	40 %	0 %	385802313
91	NC_017457	CTG	2	6	7609	7614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
92	NC_017457	CA	3	6	7703	7708	50 %	0 %	0 %	50 %	385802313
93	NC_017457	CGT	2	6	7719	7724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
94	NC_017457	A	7	7	7904	7910	100 %	0 %	0 %	0 %	385802313
95	NC_017457	GA	3	6	7945	7950	50 %	0 %	50 %	0 %	385802313
96	NC_017457	GTC	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
97	NC_017457	TCA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802313
98	NC_017457	ACG	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
99	NC_017457	TGA	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
100	NC_017457	CTG	2	6	8329	8334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
101	NC_017457	AAC	2	6	8455	8460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802313
102	NC_017457	AAAC	2	8	8471	8478	75 %	0 %	0 %	25 %	385802313
103	NC_017457	CTGT	2	8	8526	8533	0 %	50 %	25 %	25 %	385802313
104	NC_017457	CTT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802313
105	NC_017457	TGTAAT	2	12	8568	8579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385802313
106	NC_017457	GAC	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
107	NC_017457	TCT	2	6	8639	8644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802313
108	NC_017457	AGTC	2	8	8683	8690	25 %	25 %	25 %	25 %	385802313
109	NC_017457	CA	3	6	8774	8779	50 %	0 %	0 %	50 %	385802313
110	NC_017457	GGAT	2	8	8888	8895	25 %	25 %	50 %	0 %	385802313
111	NC_017457	ACG	2	6	8964	8969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
112	NC_017457	ATGG	2	8	9025	9032	25 %	25 %	50 %	0 %	385802313
113	NC_017457	TGAT	2	8	9278	9285	25 %	50 %	25 %	0 %	385802314
114	NC_017457	GTG	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802314
115	NC_017457	T	6	6	9331	9336	0 %	100 %	0 %	0 %	385802314
116	NC_017457	ACA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802314
117	NC_017457	GTC	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
118	NC_017457	AC	3	6	9417	9422	50 %	0 %	0 %	50 %	385802314
119	NC_017457	CTACT	2	10	9536	9545	20 %	40 %	0 %	40 %	385802314
120	NC_017457	TCG	2	6	9548	9553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
121	NC_017457	ACC	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802314
122	NC_017457	CTT	2	6	9670	9675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802314
123	NC_017457	AGT	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802314
124	NC_017457	GCT	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
125	NC_017457	ATT	2	6	9814	9819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802314
126	NC_017457	CAG	2	6	9865	9870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802314
127	NC_017457	TCG	2	6	9923	9928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
128	NC_017457	TGT	2	6	9939	9944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802314
129	NC_017457	T	7	7	9950	9956	0 %	100 %	0 %	0 %	385802314
130	NC_017457	ATT	2	6	9964	9969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802314
131	NC_017457	CTT	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802314
132	NC_017457	GTG	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802314
133	NC_017457	TATG	2	8	10065	10072	25 %	50 %	25 %	0 %	385802314
134	NC_017457	TTC	2	6	10155	10160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802315
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